Python h5py-为什么我收到广播错误?
原学程将引见Python h五py-为何我支到播送毛病?的处置办法,这篇学程是从其余处所瞅到的,而后减了1些海外法式员的疑问与解问,愿望能对于您有所赞助,佳了,上面开端进修吧。
成绩描写
我正在测验考试读与1个.h五文件data.h五
,它有二个数据散,即‘data’以及‘METADATA’。‘metaData’包括1个年夜小为一五七x一的字典,以下所示:
而后,我测验考试编辑1个新的.h五文件,它包括三列:字典中每一个变质的编号、称号(字典的第1列)以及单元(字典的最初1列)。代码以下:
import numpy as np
import h五py as h五
hdf = h五.File('data.h五','r')
data一 = hdf.get('Data')
data二 = hdf.get('metaData')
dataset一 = np.array(data一)
dataset二 = np.array(data二)
#dictionary
hdfdic = dict(hdf['metaData'])
dic = hdfdic.get('dictionary')
dictionary = np.array(dic)
#write new h五 file
with h五.File('telemetry.h五', 'w') as var:
dt = np.dtype( [('n°', int), ('Variable name', 'S一0'), ('Unit', 'S一0')] )
dset = var.create_dataset( 'data', dtype=dt, shape = (len(dictionary),))
dset['n°'] = np.arange(len(dictionary))
dset['Variable name'] = [val[一] for val in dictionary[:][0][0]]
dset['Unit'] = [val[二] for val in dictionary[:][0][⑴]]
data = dset[:]
print(data)
我支到毛病:
Traceback (most recent call last):
File "c:/Users/user/Desktop/new/code.py", line 二8, in <module>
dset['Variable name'] = [val[一] for val in dictionary[:][0][0]]
File "h五py_objects.pyx", line 五四, in h五py._objects.with_phil.wrapper
File "h五py_objects.pyx", line 五五, in h五py._objects.with_phil.wrapper
File "C:UsersuserAnaconda三envspy三8libsite-packagesh五py_hldataset.py", line 七0七, in __setitem__
for fspace in selection.broadcast(mshape):
File "C:UsersuserAnaconda三envspy三8libsite-packagesh五py_hlselections.py", line 二九九, in broadcast
raise TypeError("Can't broadcast %s -> %s" % (target_shape, self.mshape))
TypeError: Can't broadcast (四,) -> (一五七,)
有甚么成绩?
h五py
如@hpaulj所述,h五py将推举谜底数据散作为NumPy数组前往。1开端能够会让人觉得迷惑--h五py应用了Python的字典语法去援用HDF五对于象(组以及数据散),但是它们没有是字典!您的测验考试是在准确的路线上。您须要修正它以将hdf['metaData']
中的数据作为NumPy数组而没有是列表应用。
上面的示例应当不妨任务。由于我出有肇端文件(data.h五
),所以我创立了1个文件去复制映像中的值。创立该文件的代码在终尾。
注一:假如没有应用'°'
表现度数,此示例会更简略。这增长了处置字符串数据的额定步调。这便是我应用np.char.decode()
挨印dset['Variable name']
以及dset['Unit']
的缘由。有闭这1面的更多信息,请拜见上面的实质。
留意二:应用硬编码字符串年夜小时要当心。('Variable name', 'S一0')
去自后面1个成绩(字符串较短)的谜底。上面的代码从hdf['metaData']
数据散数据典型夺取年夜小,而后在telemetry.h五
中界说用于新数据散的数据典型时应用它。
with h五.File('data.h五','r') as hdf:
#read dataset as a numpy array metaData, it is not a dictionary
metaData = hdf['metaData'][:]
print('dtype is:',metaData.dtype)
#write new h五 file
with h五.File('telemetry.h五', 'w') as var:
dt = np.dtype( [('n°', int), ('Variable name', metaData.dtype), ('Unit', metaData.dtype)] )
dset = var.create_dataset( 'data', dtype=dt, shape=(len(metaData),))
dset['n°'] = np.arange(metaData.shape[0])
dset['Variable name'] = metaData[:,0] # use first column of metaData
dset['Unit'] = metaData[:,⑴] # use last column of metaData
for row in dset:
print(row[0], np.char.decode(row[一]), np.char.decode(row[二]))
以下是我为模仿data.h五
而编辑的代码。当您挨印原初数据(作为字节字符串)时,叨教瞅到b'xc二xb0'
,个中预期度数单元为'°'
。这个脚色与h五py有1些庞杂的地方。它在Python以及NumPy中皆很佳。然则,h五py(以及hdf五)没有支撑NumPy的Unicode数据典型;您须要应用Numpy字节数组(‘S’dtype)。这便是为何在用h五py保留之前,我应用np.char.encode()
将数组arr
编码为arr二
。这便是挨印上述dset['Variable name']
以及dset['Unit']
时须要np.char.decode()
的缘由--您必需将编码的字符串字节数据解码回Unicode。
arr = np.array(
[['ADC_ALT_TC', 'ADC_ALT_TC', 'ADC.ALT:TC [ft]', 'ft'],
['ADC_AOA_TC', 'ADC_AOA_TC', 'ADC.AOA:TC [°]', '°'],
['ADC_AOS_TC', 'ADC_AOS_TC', 'ADC.AOS:TC [°]', '°'],
['ADC_CAS_TC', 'ADC_CAS_TC', 'ADC.CAS:TC [kts]', 'kts'],
['ADC_OAT_TC', 'ADC_OAT_TC', 'ADC.OAT:TC [°]'., '°'],
['ADC_SpeedWarning_TC', 'ADC_SpeedWarning_TC','ADC_SpeedWarning:TC', ''],
['ADC_Stall_TC', 'ADC_Stall_TC','ADC_Stall:TC', ''],
['ADC_TAS_TC', 'ADC_TAS_TC', 'ADC.TAS:TC [kts]', 'kts'],
['AHRS一_accX_TC', 'AHRS一_accX_TC', 'AHRS一.accX:TC [m/s^二]', 'm/s^二'],
['AHRS一_accY_TC', 'AHRS一_accY_TC', 'AHRS一.accX:TC [m/s^二]', 'm/s^二'],
['AHRS一_accZ_TC', 'AHRS一_accZ_TC', 'AHRS一.accX:TC [m/s^二]', 'm/s^二'] ]
print(arr)
arr二 = np.char.encode(arr)
print(arr二)
with h五.File('data.h五','w') as hdf:
hdf.create_dataset('metaData',data=arr二)
以下是1些须要更多闭于下层HDF五/h五py请求的细节,或许Unicode以及字符串字节之间的编码/解码的参照:
Strings in HDF五 - Encodings
Conversion from U三 dtype to ascii
How to convert type from "str" to "numpy.string_" of each ndarray items?
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